学校有一批水平先进、设施完善的实验室和科研基地。拥有“光电材料与技术”、“有害生物控制与资源利用”、“华南肿瘤学”、“眼科学”等4个国家重点实验室，“水生经济动物繁殖营养和病害控制”、“植物基因工程”等2个国家专业实验室，“南海海洋生物技术”国家工程研究中心，“数字家庭”国家工程技术研究中心，以及“国家新药（抗肿瘤药物）临床试验”研究中心等国家级科研机构；拥有国家地方联合工程实验室6个；拥有“聚合物复合材料及功能材料”、“基因工程”、“生物无机与合成化学”、“智能传感器网络”、“信息技术”、“眼科学”、“肿瘤相关基因与抗肿瘤药物研究”、“热带病防治研究”、“干细胞与组织工程”、“水产品安全”等10个教育部重点实验室以及“超算工程软件”、“食品与健康”、“南海海洋生物技术”、“数字家庭”、“基因疫苗”5个教育部工程研究中心；拥有“眼科学”、“肾脏病临床研究”、“辅助循环”等3个卫生部重点实验室以及“医药生物”等1个卫生部工程技术研究中心，28个广东省重点实验室，14个广东省工程技术研究开发中心，8个广东省工程实验室。